Beden eğitimi çok faydalı olmakla birlikte, bazıhastalık hallerinde zararlıdır. Meselâ kalb hastalıklarını buna örnek alabiliriz. İlerlemiş kalb rahatsızlıklarında asla beden eğitimi yapmamak gerekir. Hele kalbin kapakçıklarında daralma varsa, kalb büyümüşse en küçük bir beden eğitimi hareketinden bile sakınmak lâzımdır. Eğer kalb hastalığı ilerlememişse, o zaman bazı beden hareketlerine izin verilebilir.
Fakat gene de aşırıya kaçmamak, vücudu fazla yormamak gerekir.
Verem hastaları da, kalb hastalan gibi beden eğitimi yapmaktan kaçınmalıdır; bunların evin içinde fazlaca dolaşması bile zararlıdır. Ancak verem tedavi edildikten sonra, doktorun tavsiyesine uyarak beden eğitimi yapılabilir.
Ateşli hastalıklar sırasında beden eğitimi yapılmaz. Zaten ateşli hasta kendisinde beden eğitimi yapacak gücü bulamaz. Ancak devamlı ateş sonunda, ateşe alışarak ayağa kalkacak gücü bulsa bile, hasta gene beden eğitiminden sakınmalıdır.
Böbrek hastalıklarına tutulan kimselerin beden eğitimi yapması zararlıdır. Aynı şekilde, tansiyonu yüksek olanların da beden eğitiminden kaçınması lâzımdır. Ancak, bazı hallerde, doktorun müsaadesi alınırsa hafif beden hareketleri yapılabilir.